《天行九歌》和《秦时明月》是姊妹篇，但是在故事线上是个体的，并没有什么关联。《秦时明月》讲述的是秦朝末年发生的故事，而《天行九歌》的故事背景是战国时期，讲述的是诸子百家发生的各种各样的事情。
这两部作品的部分角色和故事背景虽然有所重叠，但这两部却分别都是独立的长篇系列故事，都有着各自对的清晰主线和剧情，所以《天行九歌》不是《秦时明月》的番外篇。
在《天行九歌》的故事中，赤练依然是韩国的公主红莲，张良也还是个世家子弟，而嬴政仍旧在吕不韦的掌控之下，嬴政身边的剑客是盖聂，卫庄是新郑城中的神秘青年，李斯也在这个时候才进入秦国开始争权夺势。这并不能代表可以把两部作品放在一起解析，不然会有很多问题无法解释，因此也可以看出，它们其实就是是两部独立的作品，剧情也不是上下能够串联起来的。
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